ca.cioos ccin-13145 Laval University Québec Canada WWW:LINK https://ror.org/04sjchr03 Thaler, Mary mary.thaler.1@ulaval.ca Laval University Québec Canada WWW:LINK https://ror.org/04sjchr03 Thaler, Mary mary.thaler.1@ulaval.ca Laval University Québec Canada WWW:LINK https://ror.org/04sjchr03 Thaler, Mary mary.thaler.1@ulaval.ca 2020-03-13T00:00:00Z revision 2020-03-13 publication ISO 19115-1 Geographic information - Metadata First Edition 2014-04-01 ISO 19115-2 Geographic information - Metadata Second Edition 2019-01 ISO 19115-1 Geographic Information - Metadata Amendment 1 2018-02 Canadian Integrated Ocean Observing System Metadata Profile of ISO 19115 2019-11-06 publication Biodiversity and Gene Expression of Microbial Communities in the Canadian Arctic Biodiversité et expression génique des communautés microbiennes de l'Arctique canadien 2008-07-20 creation 2020-03-13 publication 2020-03-13 revision 1.0 Lovejoy, Connie Lovejoy, Connie Thaler, Mary Coltriano, David Freyria, Nastasia Galand, Pierre Joli, Nathalie Kalenitchenko, Dimitri Monier, Adam As part of the ArcticNet expeditions (http://www.arcticnet.ulaval.ca) on the CCGS Amundsen in 2008-2019, we collected water samples from stations throughout the Canadian Arctic. Cruise tracks varied from year to year, but always included a transect of northern Baffin Bay, and sometimes sampling in Lancaster Sound, the Beaufort Sea, and/or along the east coast of Baffin Island. The sampling period ranged from summer to autumn. Samples were collected by CTD-rosette from 2-8 depths corresponding to water column features such as surface water, the subsurface chlorophyll maximum, the nitracline, or Atlantic Water. To collect samples for DNA/RNA, water was filtered through 3-µm filters and 0.2 µm cartridges, which were conserved in a buffer at -80°C. These have been used for high-throughput sequencing for amplicon-based surveys, metagenomics, and other molecular techniques. Samples for flow cytometry (to enumerate bacterial and/or pigmented cells), microscopy (with a fluorescent DAPI stain, or using FNU preservative for identifying larger cells), fluorescent in-situ hybridization (another microscopy technique), chlorophyll a (to quantify photosynthetic organisms), and HPLC pigment analysis (to identify different algae taxa), were also collected. Samples from which nucleic acids have been extracted and sequenced in many projects. Samples from which nucleic acids have been extracted and sequenced can be found in the GenBank Short Read Archive under the project accession numbers PRJNA202104, PRJNA283142, PRJNA283296, PRJNA383398, and SRX037894-SRX037896 Dans le cadre des expéditions ArcticNet (http://www.arcticnet.ulaval.ca) à bord du NGCC Amundsen de 2008 à 2019, nous avons prélevé des échantillons d'eau dans des stations situées dans l'Arctique canadien. Les itinéraires de croisière variaient d'une année à l'autre, mais incluaient toujours un transect du nord de la baie de Baffin et parfois des séances d'échantillonnage dans le détroit de Lancaster, la mer de Beaufort et/ou le long de la côte est de l'île de Baffin. La période d'échantillonnage s'étendait de l'été à l'automne. Les échantillons ont été collectés par CTD-Rosette à 2 à 8 profondeurs correspondant aux caractéristiques de la colonne d'eau telles que l'eau de surface, le maximum de chlorophylle souterraine, la nitracline ou l'eau de l'Atlantique. Pour prélever des échantillons d'ADN/ARN, l'eau a été filtrée à l'aide de filtres de 3 µm et de cartouches de 0,2 µm, qui ont été conservés dans un tampon à -80 °C. Ces filtres ont été utilisés pour le séquençage à haut débit pour des enquêtes basées sur l'amplification, la métagénomique et d'autres techniques moléculaires. Des échantillons ont également été prélevés pour la cytométrie en flux (pour dénombrer les cellules bactériennes et/ou pigmentées), la microscopie (avec un colorant DAPI fluorescent ou l'utilisation d'un conservateur FNU pour identifier les cellules plus grosses), l'hybridation fluorescente in situ (une autre technique de microscopie), la chlorophylle a (pour quantifier les organismes photosynthétiques) et l'analyse des pigments par HPLC (pour identifier différents taxons d'algues). Échantillons à partir desquels des acides nucléiques ont été extraits et séquencés dans le cadre de nombreux projets. Des échantillons dont les acides nucléiques ont été extraits et séquencés peuvent être trouvés dans les archives GenBank Short Read sous les numéros d'accession du projet PRJNA202104, PRJNA283142, PRJNA283296, PRJNA383398 et SRX037894-SRX037896 oceans true -140.7963 -51.8733 62.3845 81.7535 true ca.cioos 1 {'en': 'Arctic Ocean, Canada - NAABK'} 0 0 5829 EPSG 2012-08-10T00:00:00 Instantaneous Water Level height - Height relative to instantaneous water level uncorrected for tide. Not specific to any location or epoch. vertical 2008-07-20T00:00:00Z 2019-08-11T00:00:00Z asNeeded Generated from https://cioos-siooc.github.io/metadata-entry-form#/en/amundsen/c8GqCtwH6sZnf3HtZhCgkOsmtoh1/ccin-13145 Oceans Government of Canada Core Subject Thesaurus 2016-10-13 N/A DNA Protists Canadian Arctic Archipelago Baffin Bay Arctic Ocean Beaufort Sea RNA Bacteria Canada - NAABK Marine ecology Phytoplankton Amundsen Science-Amundsen Science ArcticNet IPY-CFL TAKUVIK - Ocean Amundsen Science-Amundsen Science ArcticNet IPY-CFL TAKUVIK - Ocean default phytoplanktonBiomassAndDiversity Biomasse et diversité de phytoplancton eov Amundsen Science-Amundsen Science ArcticNet IPY-CFL TAKUVIK - Ocean project Creative Commons Attribution 4.0 Attribution CC-BY-4.0 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0 WWW:LINK Polar Data Catalogue equivalent record Enregistrement équivalent du Catalogue de données polaires URL https://www.polardata.ca/pdcsearch/PDCSearchDOI.jsp?doi_id=13145 Laval University Québec Canada WWW:LINK https://ror.org/04sjchr03 Thaler, Mary mary.thaler.1@ulaval.ca https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSdvBGLgaXHF1auiYcF2cKuoZzVTVevtkyUyL5lKSBq3DlN2Fg/viewform?usp=pp_url&entry.1112188064=https%3A%2F%2Fcatalogue.amundsenscience.com%2Fdataset%2Fca-cioos_ccin-13145&entry.1881810302=%5B%7B%22givenNames%22%3A%20%22Connie%22%2C%20%22lastName%22%3A%20%22Lovejoy%22%2C%20%22indEmail%22%3A%20null%2C%20%22orgName%22%3A%20null%2C%20%22orgEmail%22%3A%20null%7D%2C%20%7B%22givenNames%22%3A%20%22Mary%22%2C%20%22lastName%22%3A%20%22Thaler%22%2C%20%22indEmail%22%3A%20%22mary.thaler.1%40ulaval.ca%22%2C%20%22orgName%22%3A%20%22Laval%20University%22%2C%20%22orgEmail%22%3A%20%22%22%7D%5D WWW:LINK Data Access Request Form Formulaire de demande d'accès aux données Data is not publicly accessible. Please refer to the contact information to access the dataset or submit a data access request form. Les données ne sont pas accessibles publiquement. Veuillez vous référer aux informations de contact pour accéder au jeu de données ou soumettre un formulaire de demande d'accès aux données. asNeeded 18DL CCGS Amundsen NGCC Amundsen ship